chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,CALML6,TMEM52	NA	NA	NA	NA	CALML6	3431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	2231691	2232185	2232046	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	88961	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	3297180	3297261	3297221	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	228798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	7313313	7313451	7313382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	469929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	6.24443010130734
chr1	8054249	8054565	8054423	Y	NA	PARK7,ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	29803	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	8107848	8108157	8108001	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	23050	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	69719	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	8173446	8173525	8173493	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	88648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr1	8181009	8181247	8181098	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	96211	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	8195042	8195246	8195144	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	110244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	113290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	8214748	8215059	8214907	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	129950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	120979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	8264458	8264788	8264713	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	111098	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	103496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	8300045	8300389	8300198	Y	NA	NA	PARK7,ERRFI1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	75497	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166271	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	15415174	15415506	15415314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	61522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	9980	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr1	17253207	17253541	17253218	Y	NA	RP11-108M9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-108M9.4	39063	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	19276270	19276542	19276361	Y	AKR7A2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	4638	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	19794978	19795283	19795050	Y	PLA2G2E,UBR4	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	14783	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	19803913	19804113	19803998	Y	PLA2G2E,TMCO4,UBR4	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	5953	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21406931	21406946	21406939	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	8685	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	23977708	23977880	23977794	Y	NA	RPL11	NA	NA	NA	NA	RPL11	38389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	25250110	25250319	25250228	Y	NA	NA	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	CLIC4	180262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	MIR3917	29188	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	26615016	26615421	26615346	Y	SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	11349	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	NA	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	TRNP1	65759	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	31227443	31228328	31227673	Y	LAPTM5	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	LAPTM5	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	LAPTM5	13128	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	34462454	34462825	34462727	Y	CSMD2,HMGB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	526208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	39662647	39663006	39662738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	117659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	41622480	41622650	41622563	Y	NA	NA	CTPS,LOC100507178	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	83176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr1	42351041	42351345	42351193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	148251	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	42385609	42385954	42385889	Y	FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	113642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	43250353	43250859	43250610	Y	ZMYND12,WDR65,YBX1	LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23	NA	NA	NA	NA	C1orf50	19413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	44897170	44897489	44897243	Y	NA	RNF220	NA	NA	NA	NA	RNF220	28304	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	52193179	52193464	52193255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	149013	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	55678785	55679185	55678893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP24	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	57887813	57887926	57887901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	632226	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59039624	59039692	59039640	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	OMA1	29150	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	OMA1	39406	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59083966	59084335	59084186	Y	NA	NA	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OMA1	73492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59229881	59230252	59230003	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	17533	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	59761390	59761720	59761439	Y	NA	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	60142118	60142218	60142180	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	381808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	60144543	60144796	60144669	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	384233	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	396768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	436256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	359133	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	358223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	67494221	67494361	67494358	Y	SLC35D1,MIER1	SLC35D1	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	23421	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	70635460	70635702	70635581	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	LRRC40	33601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	70877943	70877992	70877968	Y	CTH	CTH	NA	NA	NA	NA	CTH	3042	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78021710	78022056	78021808	Y	AK5,AK5,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	125048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	79518661	79518859	79518772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	405180	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	87082786	87082842	87082814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	85417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	90226973	90227143	90227059	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	LRRC8C,LRRC8D	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8D	57430	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	92201825	92202076	92201951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167816	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	92781340	92781526	92781459	Y	TGFBR3,RPAP2	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	GLMN	18796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	112754	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	80815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr1	94228958	94229141	94229050	Y	NA	RP11-488P3.1	MIR760,BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	9859	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	5939	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	94309612	94309956	94309784	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	MIR760	432	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	36759	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	836	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr1	95464838	95464926	95464881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	71575	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	97731783	97731967	97731875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	277290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98334223	98334553	98334370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	50052	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	23.8213444605428
chr1	98497100	98497277	98497188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	112495	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	98499783	98500490	98500262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	115178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	15.726712847737
chr1	98550811	98551163	98550987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	123140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	67841	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98642709	98642844	98642773	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	31459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	98677142	98677181	98677162	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	2839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	98781999	98782036	98782018	Y	NA	NA	LOC729987	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	107696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	115193	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	98868515	98868612	98868566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	194212	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	82497	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	111212876	111213052	111212966	Y	RBM15,CD53,KCNA2,KCNA3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	281172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	113525578	113525919	113525789	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A1	27943	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	113584893	113585079	113584961	Y	NA	RP11-31F15.2,LRIG2	SLC16A1,AKR7A2P1,RHOC,PPM1J	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-31F15.2	28648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	116923407	116923493	116923480	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	10117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	64233	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	59740	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	117130518	117130699	117130624	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	18857	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	117256857	117256976	117256917	Y	NA	IGSF3	CD101,TTF2	IMR90	Hi-C	24141950	IGSF3	48482	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	118415993	118416217	118416147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP2	54036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	279620	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H3DP1	582407	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	142536204	142536464	142536463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	1608344	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	145701524	145701615	145701570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF115	92488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4	NA	NA	NA	NA	SF3B4	12664	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	149978692	149979077	149978971	Y	SV2A,CA14,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1548	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	151943125	151943453	151943289	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	21413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	154584095	154584221	154584156	Y	NA	ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	14254	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	155568911	155569221	155569066	Y	ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676	IMR90	Hi-C	24141950	ASH1L	38313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	11467	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	157030350	157030742	157030546	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	17188	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	157124774	157125221	157124855	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	ETV3,ETV3L	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETV3	18508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	158253654	158254229	158253918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	292591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	222772	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	216649	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	162129294	162129634	162129458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	91730	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	162729988	162730048	162730018	Y	NOS1AP,UHMK1	HSD17B7	NA	NA	NA	NA	HSD17B7	28444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	162830850	162831244	162831104	Y	NA	C1orf110	NA	NA	NA	NA	C1orf110	5361	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr1	162846595	162846764	162846655	Y	DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	C1orf110	C1orf110,RGS4,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf110	9990	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.16295340087156
chr1	162937771	162938014	162937902	Y	C1orf110	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	98551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	81735	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr1	165674774	165675083	165674866	Y	NA	ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	8674	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	168660111	168660285	168660198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	411833	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	173167258	173167319	173167289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	277086	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	173370600	173370810	173370705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	73595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	173984193	173984403	173984298	Y	GPR52,ZBTB37,RC3H1	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	5032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	174132447	174132507	174132478	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	5899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	128843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	75584	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	184852237	184852590	184852311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	89092	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	185129185	185129369	185129253	Y	NA	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	SWT1	4973	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	185344563	185345243	185344914	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	60102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	187996792	187997117	187996893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1103306	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	190151480	190151877	190151832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1051057	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	1185875	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	192923906	192924334	192924233	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	TROVE2	102218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	77049	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1,MYBPH	NA	NA	NA	NA	MYBPH	41695	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	206890641	206891001	206890773	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	34352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	206910483	206910789	206910591	Y	RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	54194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	208314292	208314663	208314422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf132	273797	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	211258865	211259253	211259186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	85566	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	211753366	211753524	211753445	Y	TRAF5	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	3282	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	214619335	214619608	214619472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	104184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	217416527	217416611	217416569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	385813	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	219433064	219433395	219433229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	87878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.08805415662079
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	CNIH3,WDR26	NA	NA	NA	NA	CNIH3	21944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	224727681	224727955	224727807	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	104946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	224805633	224805908	224805866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L21.2	110456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L21.2	104321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	RP11-3L21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-3L21.2	1575	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	226219862	226220210	226220014	Y	H3F3A,C1orf55	H3F3A	H3F3A,C1orf55	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	27342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	6.70698047918196
chr1	229692979	229693368	229693287	Y	NUP133,TAF5L,ABCB10	ABCB10	NA	NA	NA	NA	ABCB10	537	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	NTPCR	349061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	NTPCR	318224	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	234680207	234680593	234680360	Y	NA	NA	LOC100506795,IRF2BP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	62678	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr1	234757412	234757805	234757606	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	LOC100506810	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IRF2BP2	14141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	12110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr1	234857710	234858181	234857899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	77675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	235091073	235091332	235091158	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	23219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19361	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	235927486	235927702	235927520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG4	115432	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	235994307	235994722	235994588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	50218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	236025805	236026204	236025994	Y	LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	18736	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	236041479	236041632	236041556	Y	NA	LYST	LYST,GNG4,B3GALNT2,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	3308	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	243995795	243995860	243995825	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	16521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	245080504	245080636	245080561	Y	C1orf101	NA	COX20,HNRNPU,SMYD3,EFCAB2,C1orf101,PPPDE1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	50371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247038123	247038250	247038187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	55030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr1	247537279	247537425	247537333	Y	NA	ZNF496	AHCTF1,ZNF496	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	44131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	593455	593774	593616	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	139909	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3497590	3497951	3497729	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	284587	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3568141	3568290	3568192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	257183	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3800307	3800531	3800378	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	24942	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.00657745618501
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3850308	3850795	3850409	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	24835	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3856317	3856712	3856416	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6,AKR1E2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	30844	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	3868851	3869035	3868973	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	43378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	8.55718199068043
chr10	3985648	3985956	3985684	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	160175	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	162525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	3991165	3991394	3991297	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	165692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	4358748	4358982	4358870	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	359364	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	5126	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.3193293455581
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00704	56998	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	4807724	4807860	4807810	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00704	89378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	4812953	4813314	4813133	Y	NA	NA	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	94607	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	4813646	4813900	4813754	Y	NA	NA	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	95300	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	4824253	4824390	4824315	Y	NA	NA	KLF6,PITRM1,PFKP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	105907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	NA	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	77380	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	4895704	4895738	4895721	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	37058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	4937004	4937357	4937181	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	4208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	45786	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	6193489	6193806	6193647	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8608	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	6600320	6600578	6600409	Y	RBM17,RBM17,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	415439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN,CCDC3	NA	NA	NA	NA	CCDC3	3289	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111	NA	NA	NA	NA	C10orf111	20312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	15165954	15166084	15166019	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	28636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	16906337	16906676	16906506	Y	NA	RSU1	NA	NA	NA	NA	RSU1	48810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	16946653	16946941	16946801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	89126	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17010242	17010673	17010572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	152715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	17028207	17028677	17028581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	170680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17034715	17035049	17034848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	177188	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17037933	17038521	17038161	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	180406	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17044035	17044524	17044318	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	186508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17045086	17045410	17045363	Y	VIM,TRDMT1	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	187559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17046094	17046522	17046399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	188567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.78187972343272
chr10	17067559	17067950	17067759	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	174103	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17068694	17069080	17068926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	172973	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17070785	17071064	17070923	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	170989	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	17071536	17072103	17071684	Y	VIM,TRDMT1	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	169950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	17104584	17104750	17104681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	137303	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	17280857	17281170	17281014	Y	TRDMT1,VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	6025	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	1010719	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	22029877	22030194	22029992	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	189878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	22932994	22933290	22933224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	22972039	22972536	22972328	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	28948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	27028326	27028583	27028339	Y	MASTL,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	43738	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	113795	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	31805465	31805855	31805582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	198089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	32639699	32640002	32639940	Y	NA	EPC1	EPC1,C10orf68	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	25724	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	34922261	34922558	34922409	Y	PARD3	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	28471	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	35668149	35668482	35668241	Y	CREM,CREM	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	134196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	45463684	45463996	45463754	Y	ALOX5,RASSF4	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	8262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	49564940	49565014	49564977	Y	NA	NA	ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	52242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	51039519	51039692	51039605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	71094	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24866	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	54208151	54208375	54208306	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	19918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	61019605	61019954	61019626	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A9	473806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	61639238	61639777	61639520	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	24637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	61645173	61645419	61645305	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	18995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	64488428	64488586	64488476	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	EGR2	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	73930	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4,MYPN	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	49395	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70817174	70817630	70817194	Y	NA	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	28232	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70832840	70833011	70832951	Y	DDX21,SRGN	SRGN,VPS26A	SRGN	K562	ChIA-PET	22265404	SRGN	12851	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70853829	70854114	70853839	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	7967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	71283312	71283690	71283502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	74083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	66863	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	71657953	71658245	71658099	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	98309	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	73605642	73606023	73605974	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3103	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	74085147	74085316	74085305	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	27672	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	75253773	75253975	75253905	Y	NA	RP11-137L10.6	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	82509932	82510235	82510106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	298010	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	119468	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	88622539	88622751	88622747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCG	93624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	6.47570529024465
chr10	91055339	91055739	91055572	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	3973	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr10	91056148	91056487	91056304	Y	FAS,IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	3225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	95193537	95193891	95193765	Y	MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	46183	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	103600514	103600739	103600526	Y	NA	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	23818	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	105630915	105631032	105630972	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	44931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	105631960	105632231	105632145	Y	GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	43732	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	MIR4482-1,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	MIR4482-1	26627	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	108691191	108691511	108691422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	2595029	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	111650301	111650520	111650491	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	30791	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	111666185	111666517	111666351	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	14794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	111971446	111971590	111971518	Y	NA	MXI1	NA	NA	NA	NA	MXI1	6083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	114929772	114930211	114930015	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	221763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	115022033	115022434	115022235	Y	NA	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	314024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	C10orf118	NA	NA	NA	NA	C10orf118	8081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	121076325	121076636	121076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	139980	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	121464053	121464453	121464171	Y	BAG3	NA	INPP5F,MCMBP,SEC23IP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	55171	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	121682284	121682432	121682358	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	32061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	146053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	126021099	126021412	126021201	Y	CHST15	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	84133	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	126212520	126212862	126212532	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	35373	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	127576777	127576887	127576832	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	360	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK32C	263827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr10	135071993	135072118	135072056	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	47861	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr10	135119353	135119734	135119518	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	245	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	NA	NA	NA	NA	NA	PHRF1	54706	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	NA	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	180727	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	1791889	1792111	1791952	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39	IGF2,INS-IGF2,IGF2-AS1,TH,MIR4686,MOB2,IFITM10	H1ESC,GM12878,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,3C,ChIA-PET	22955621,24141950,19890323,22265404	AC068580.7	5507	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	3583	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	AC068580.7	2643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr11	2619837	2620105	2619972	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	99119	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	9703256	9703389	9703323	Y	WEE1	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	19632	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	10951981	10952433	10952195	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	33112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	10955517	10955651	10955533	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	36648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	12136145	12136580	12136313	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	22602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	279551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	16457424	16457760	16457639	Y	SOX6,SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	174919	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	17929463	17929485	17929474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	103224	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	18444585	18444736	18444661	Y	SAAL1	LDHA,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHC	12731	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1L12.3	99014	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	30127536	30127914	30127726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC1	1261443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	160602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	35053022	35053283	35053109	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr11	35165614	35166208	35165794	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	7197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44,RP1-68D18.2	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	35187357	35188072	35187739	Y	NA	RP4-607I7.1,CD44,RP1-68D18.2	NA	NA	NA	NA	CD44	28940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44,RP1-68D18.2	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44,RP1-68D18.2	NA	NA	NA	NA	RP1-68D18.2	26760	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	36678662	36678763	36678713	Y	PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	64611	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	45110922	45111223	45111073	Y	TP53I11	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	140082	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	45166793	45166902	45166852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	195953	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	46094625	46094954	46094790	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	46031	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	46423430	46423619	46423525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZ	70975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	57083068	57083441	57083322	Y	NA	TNKS1BP1,SSRP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	6985	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr11	58399673	58399754	58399714	Y	OR9Q2,OR1S2,OR1S1,OR10Q1,OR10W1,OR5B3,OR5B2,OR5B12	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP91-CNTF	55028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	61746281	61746413	61746325	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	13149	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65152750	65152863	65152819	Y	LOC100130348,CDC42EP2,DKFZp761E198,FRMD8	TIGD3,SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NA	NA	NA	NA	FRMD8	680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	10.1761083132416
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	65949541	65949768	65949655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLC2	72997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFITM9P	113683	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	127588	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	72808468	72808618	72808564	Y	NA	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	42688	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	72985787	72986008	72985881	Y	FCHSD2,RELT,RELT,P2RY6	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	P2RY6	12237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	73729347	73729733	73729506	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	36995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	14345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	76674520	76674873	76674698	Y	B3GNT6	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	101106	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	77913844	77914005	77913927	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	15976	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	92083144	92083535	92083339	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	845595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	93366406	93366557	93366482	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	26248	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102176886	102177264	102177169	Y	NA	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8951	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102296028	102296376	102296245	Y	NA	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	42739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	111850074	111850218	111850143	Y	NA	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	43320	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	16061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	116857252	116857500	116857432	Y	SIK3	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	47267	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	117853654	117853757	117853706	Y	NA	IL10RA	IL10RA	K562	ChIA-PET	22265404	IL10RA	1306	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	15912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	119595869	119596204	119596037	Y	NA	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	1590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	124514246	124514548	124514258	Y	OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1,SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	TBRG1	23514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129244480	129244782	129244484	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr11	129251937	129252027	129251992	Y	BARX2	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	8102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129258072	129258268	129258170	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	14237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129282439	129282677	129282511	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	38604	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129507501	129507545	129507523	Y	BARX2,NFRKB	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	NFRKB	255940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	129509159	129509661	129509390	Y	BARX2	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	NFRKB	253824	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129920255	129920483	129920343	Y	APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14	IMR90	Hi-C	24141950	APLP2	17249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	32664	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	189971	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	1532185	1532472	1532256	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	168859	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	116999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	NA	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	57711	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	DCP1B	32576	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	2538266	2538493	2538380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	363626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	3334572	3334968	3334768	Y	NA	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	15476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	4245075	4245501	4245252	Y	PARP11,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	135437	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	6031299	6031457	6031386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	275424	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	6854848	6855156	6854990	Y	TAPBPL,VAMP1,CHD4,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4	COPS7A,PTMS,MLF2,LAG3	NA	NA	NA	NA	PTMS	17526	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	6901890	6902092	6902006	Y	TAPBPL,IFFO1,CHD4,ING4,ZNF384,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4	PTMS,MLF2,LAG3,GPR162,LEPREL2	NA	NA	NA	NA	LAG3	22212	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	68935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	105076	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr12	11582484	11582789	11582637	Y	TAS2R50,TAS2R43,TAS2R42	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	217999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	11755379	11755464	11755421	Y	NA	ETV6	ETV6	IMR90	Hi-C	24141950	ETV6	45324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	11806275	11806670	11806607	Y	BCL2L14,ETV6	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	5487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	209199	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	97541	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	12594845	12595716	12595015	Y	LOH12CR1,GPR19,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	86832	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12775556	12775830	12775680	Y	LOH12CR1,CDKN1B,APOLD1,DUSP16	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	12795	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	3838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	6761	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	35030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.70040302299694
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	GSG1	NA	NA	NA	NA	GSG1	72	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	13376628	13377027	13376828	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28978	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	16125205	16125413	16125310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	63099	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	640085	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	11.3324842579281
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	26944008	26944360	26944283	Y	STK38L,C12orf71	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	39771	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	28433746	28433796	28433771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-967K21.1	92447	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	31524246	31524432	31524371	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	46254	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	42734111	42734478	42734288	Y	NA	ZCRB1	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	16191	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	46866769	46866797	46866784	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	91307	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr12	46942703	46943018	46942760	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	167241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	47033293	47033660	47033445	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	257831	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	278298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	410274	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	415907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	47294477	47294629	47294480	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	519015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	47310900	47311079	47310914	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	535438	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP3	513999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	52575658	52575765	52575707	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	8019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	53892109	53892322	53892185	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	56731526	56731745	56731650	Y	MMP19,ZC3H10,STAT2,PAN2,PAN2,IL23A	RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	PAN2	5689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.85677896768348
chr12	57724914	57725046	57724980	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9,GLI1,MARS,NDUFA4L2,SHMT2,DDIT3,MBD6	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA4L2	92416	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	62609319	62609899	62609601	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	42220	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61	NA	NA	NA	NA	C12orf61	30057	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	63097406	63097648	63097535	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf61	102192	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf61	123666	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf61	154243	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	63177678	63177947	63177765	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	148870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	64349679	64350074	64349795	Y	TBK1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	113606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	64414724	64414736	64414730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	178651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	66507107	66507255	66507181	Y	NA	RP11-745O10.2,LLPH	NA	NA	NA	NA	RP11-745O10.2	15276	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	75872211	75872563	75872333	Y	GLIPR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	30853	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	75946648	75946656	75946652	Y	NA	KRR1	OSBPL8,NAP1L1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	43232	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	75983166	75983173	75983170	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	79750	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	76026406	76026738	76026572	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	122990	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76045179	76045405	76045348	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	141763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76053870	76054229	76054024	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	150454	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	76061758	76061867	76061813	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	158342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	76114737	76114966	76114777	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76116548	76116691	76116626	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	213132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76178520	76178723	76178659	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	246989	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76183993	76184325	76184134	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	241387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	76186706	76186834	76186771	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	238878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	76197528	76197897	76197766	Y	KRR1	NA	KRR1,PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	227815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	76209246	76209451	76209339	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	216261	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	76215246	76215339	76215312	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	210373	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr12	76248800	76249037	76248808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	176675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	76256965	76257237	76257100	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	168475	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76283192	76283327	76283260	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	142385	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76329256	76329552	76329445	Y	NA	NA	KRR1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	96160	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	76811286	76811641	76811626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS10	71064	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	77060081	77060100	77060091	Y	NA	NA	E2F7,ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC17	95268	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	79323956	79323978	79323967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	758899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	88526600	88526872	88526736	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	7121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	89529729	89530218	89529963	Y	DUSP6	NA	DUSP6,POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	214830	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	89577739	89578367	89578025	Y	NA	NA	DUSP6,POC1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	166681	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	92955380	92955568	92955421	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	365539	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	93002299	93002373	93002366	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	318734	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	94681590	94681805	94681698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	134940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	104193580	104193857	104193839	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	39118	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	107424746	107425166	107425085	Y	NA	MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	45802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	110567516	110567657	110567554	Y	NA	IFT81	NA	NA	NA	NA	IFT81	7376	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	ARPC3	18728	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	111053049	111053390	111053220	Y	NA	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	3217	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	113741046	113741165	113741159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLBD2	53206	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	121019899	121020145	121020000	Y	NA	COQ5,POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	2698	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM120B	23540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	122225058	122225273	122225168	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	122462417	122462775	122462615	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	7089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.39422858980887
chr12	125050536	125050830	125050706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	314384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125332280	125332520	125332389	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	32694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125369233	125369624	125369429	Y	NA	SCARB1,UBC	UBC	K562	ChIA-PET	22265404	SCARB1	4019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	20704420	20704798	20704605	Y	NA	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	28390	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	23733450	23734509	23733658	Y	NA	HMGA1P6	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	27137	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	25856268	25856641	25856378	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	3506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	27728821	27729155	27728988	Y	USP12	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	14878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	30812389	30812594	30812492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	55690	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	34727619	34727920	34727781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	337433	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	35080715	35081091	35080903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	433333	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	41624170	41624528	41624466	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90	Hi-C	24141950	WBP4	8882	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	42222511	42222753	42222632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	339170	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	473361	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	42422497	42422720	42422629	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	421569	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	42509903	42509914	42509909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	334375	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	44440154	44440346	44440262	Y	CCDC122,C13orf31,C13orf31	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	11074	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	45059021	45059160	45059095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	90123	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	50630657	50630910	50630784	Y	NA	MIR16-1,DLEU1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	9460	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	51167597	51167659	51167628	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	233698	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	51168515	51168827	51168588	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	234616	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	52572353	52572390	52572372	Y	NA	ATP7B,ALG11,UTP14C	NA	NA	NA	NA	ATP7B	11240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	56195	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	64508473	64508866	64508848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	139278	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	64537945	64538229	64538154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	109915	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	64563606	64563820	64563696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	84324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	80350805	80350890	80350848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	297518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	80357144	80357292	80357207	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP2	303857	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	80611659	80611975	80611764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	301111	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	80705470	80705610	80705560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	207476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	96332135	96332467	96332276	Y	NA	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	4742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	99075	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	100886726	100886738	100886732	Y	NA	NA	A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P18	85380	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	627878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	111022548	111022884	111022711	Y	ING1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	65052	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	23466095	23466339	23466236	Y	CDH24,ACIN1	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	11036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	24014427	24014724	24014635	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	8492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	25625433	25625557	25625532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	108985	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	32420109	32420203	32420156	Y	NA	NA	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-187E13.2	53905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EAPP	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	36690	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	35303172	35303324	35303248	Y	SRP54,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	39529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	17339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	39664073	39664414	39664121	Y	SIP1,PNN	TRAPPC6B,PNN	NA	NA	NA	NA	PNN	21686	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	50256678	50256775	50256761	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	24352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	5806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3392	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3612	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr14	50497743	50497949	50497828	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	C14orf182,RP11-58E21.3	C14orf182,SOS2,C14orf183,ARF6,METTL21D	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-58E21.3	7998	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	22550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	51066593	51066625	51066609	Y	TRIM9,CDKL1,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	40749	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	51367871	51368235	51368053	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	41219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	52389104	52389259	52389151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	64934	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	168413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	56045964	56046135	56045995	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	1136	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	57725682	57725794	57725735	Y	NA	EXOC5	NA	NA	NA	NA	EXOC5	7932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	61571196	61571403	61571326	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	80874	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	61654939	61655124	61655060	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	2662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	133500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	62454456	62454478	62454466	Y	SYT16	NA	SYT16	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	157369	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM71D	175758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM71D	90834	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr14	68571232	68571846	68571404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	286736	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68610058	68610732	68610311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	276181	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	252404	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	69143232	69143639	69143443	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	6643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69148442	69148779	69148611	Y	NA	CTD-2325P2.3	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	1503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69161300	69161452	69161356	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	11018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	CTD-2325P2.3	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.3	11736	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	69248827	69249033	69248912	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	12157	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	69598076	69598493	69598218	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	19374	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	71425019	71425182	71425094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNX	52897	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	14952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	74918684	74918707	74918696	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	VRTN	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4709	26200	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	40329	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	75084188	75084360	75084254	Y	PGF,EIF2B2	CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	2838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	145535	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	144949	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	78393381	78393611	78393501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	128955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	84032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	89680457	89680908	89680785	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	75030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	91096658	91097052	91096895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	183771	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	91817428	91817689	91817484	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	64499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	98011080	98011227	98011154	Y	NA	NA	BCL11B	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	749439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	42745	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	310239	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	313915	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	318116	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr14	102183174	102183299	102183226	Y	NA	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	12146	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr14	105549558	105549976	105549724	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	64073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	6059	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	25766793	25766905	25766849	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	84665	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	31627410	31627711	31627458	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	10352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8B	71262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	35599049	35599138	35599102	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	320561	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	371677	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	576515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	50948351	50948714	50948533	Y	NA	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	28298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	51598187	51598615	51598465	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	314415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	51628727	51629122	51629096	Y	TNFAIP8L3,CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	283908	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	58542075	58542356	58542213	Y	NA	NA	SLTM,ADAM10,LIPC,FAM63B	IMR90	Hi-C	24141950	LIPC	158412	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	58551930	58552325	58552121	Y	NA	NA	SLTM,ADAM10,FAM63B,LIPC	IMR90	Hi-C	24141950	LIPC	148443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.85677896768348
chr15	58733027	58733372	58733200	Y	NA	LIPC	NA	NA	NA	NA	LIPC	32259	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	59536723	59536869	59536795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	126023	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	59688558	59688897	59688728	Y	NA	FAM81A,MYO1E	MYO1E,LDHAL6B,FAM81A	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1E	25459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	220364	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	63792570	63793348	63792650	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	1445	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	64060591	64060833	64060743	Y	USP3,HERC1,DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	63308	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr15	65277772	65277992	65277893	Y	OAZ2,PLEKHO2	SPG21,MTFMT	NA	NA	NA	NA	SPG21	2656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	65831867	65832220	65831871	Y	NA	DPP8,PTPLAD1	C15orf44	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD1	11111	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	219173	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	68366463	68366575	68366519	Y	NA	PIAS1	NA	NA	NA	NA	PIAS1	21946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	70785060	70785587	70785260	Y	TLE3	NA	KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	268345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	70867778	70867861	70867857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UACA	186071	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	71144876	71145062	71144944	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	71872548	71872837	71872596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	531762	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	72265573	72265641	72265607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	138958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	35515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	74346326	74346621	74346416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	61312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2Q2	82544	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	NA	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ADAMTS7	50735	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	83479679	83480264	83480017	Y	WHAMM	WHAMM	HOMER2	IMR90	Hi-C	24141950	WHAMM	3299	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	83990986	83991134	83991044	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	116216	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	86163966	86164265	86164150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	171996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	86267980	86268030	86268003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68231	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	86285642	86285870	86285715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	50391	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	86321738	86321858	86321816	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	14403	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	88798414	88798598	88798494	Y	NTRK3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL46	210052	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	89187882	89188205	89187952	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	10498	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	90241907	90242276	90242092	Y	NA	KIF7,PEX11A	NA	NA	NA	NA	PEX11A	9893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	90402022	90402269	90402146	Y	NA	AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	33305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	17947	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	ASB9P1	26620	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	37903	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	96630507	96630843	96630653	Y	NA	NA	LOC400456,LOC145820,NR2F2	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	236324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	27642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	31918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	210821	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	101102236	101102405	101102321	Y	NA	ASB7,LINS	NA	NA	NA	NA	ASB7	38334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr15	101644256	101644549	101644403	Y	NA	NA	CHSY1,SELS,ASB7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHSY1	145588	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX8	103312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	2924940	2925188	2925019	Y	NA	PRSS30P,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLYWCH2	5999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	11308064	11308220	11308142	Y	NA	RMI2,SOCS1	SOCS1,CLEC16A,PRM3,PRM2,TNP2,RMI2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RMI2	33256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	11489659	11490054	11489857	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	141623	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	11946483	11946539	11946512	Y	NA	RSL1D1	NA	NA	NA	NA	RSL1D1	3041	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	12713340	12713716	12713664	Y	NA	NA	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	CPPED1	182158	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	13392	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	28860977	28861369	28861174	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	5056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	10.1761083132416
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	46392244	46392645	46392447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	260893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	47072084	47072446	47072376	Y	DNAJA2	NA	ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJA2	66385	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	47669133	47669265	47669199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFG1	173073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	50073136	50073358	50073247	Y	ZNF423,TMEM188	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	24494	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	51572702	51572897	51572800	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	104770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	51797343	51797505	51797414	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	119676	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	57350531	57350815	57350676	Y	NA	PLLP	CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17	IMR90	Hi-C	24141950	PLLP	33932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	58159860	58159971	58159905	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	1383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	58299498	58299672	58299601	Y	NA	CCDC113,GINS3	NA	NA	NA	NA	GINS3	27312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	58509329	58509501	58509415	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	37882	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	66440915	66440994	66440955	Y	CMTM3,CMTM3	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	66962213	66962449	66962329	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	FAM96B	3877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	67011641	67011860	67011695	Y	NA	FAM96B,CES2,CES3,CES4A,CBFB	NA	NA	NA	NA	CES4A	8632	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	67895003	67895199	67895134	Y	TPPP3,CENPT	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	9727	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69019845	69020210	69019891	Y	NA	NA	CHTF8,HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	CHTF8	132121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr16	70716686	70717066	70716876	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	903	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	70740989	70741599	70741286	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	23020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74599295	74599588	74599442	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	39424	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75286788	75287025	75286897	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	12926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75454988	75455069	75455029	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	CFDP1	10314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	75496858	75497008	75496924	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75604496	75604511	75604504	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	6247	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	81491583	81491773	81491678	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	14808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	81843531	81843617	81843550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	72829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	81876424	81876656	81876582	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	105722	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84624738	84624752	84624744	Y	HSDL1,COTL1	COTL1	NA	NA	NA	NA	COTL1	24931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84784930	84785133	84785062	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84788106	84788226	84788167	Y	COTL1	NA	NA	NA	NA	NA	USP10	56522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	84799622	84799923	84799772	Y	KLHL36	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	51667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	86962886	86963146	86962899	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	376045	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	87359959	87360279	87360119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	55322	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	88535003	88535267	88535135	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	17278	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89423849	89423969	89423923	Y	CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	131000	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr16	90088262	90088277	90088270	Y	PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	3726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	1626372	1626653	1626476	Y	CRK,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	7904	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	1773985	1774184	1774050	Y	SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4	RPA1,SMYD4,AC016292.3	NA	NA	NA	NA	AC016292.3	14245	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr17	2126107	2126815	2126522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	77862	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	2163031	2163247	2163098	Y	SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	41430	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	2652547	2653322	2653300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	158043	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	4233037	4233303	4233170	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	34620	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	6478669	6478853	6478761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	63225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr17	7784207	7784538	7784352	Y	POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2	CYB5D1,CHD3,LSMD1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	CHD3	1586	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	12423274	12423690	12423507	Y	NA	NA	ELAC2,FLJ34690	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP44	267166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	13835210	13835376	13835282	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	135436	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	15368147	15368483	15368202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	106850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2,FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	131085	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27405810	27406234	27406188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	99196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	27766880	27767142	27766912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	51200	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	29334745	29335135	29334940	Y	RAB11FIP4,OMG	RNF135	NA	NA	NA	NA	RNF135	40942	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	920637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP2B1	115967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	21993	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	RP11-445F12.1,AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-445F12.1	13803	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	35425108	35425365	35425237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	120933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	37749329	37749495	37749400	Y	CACNB1,THRA,TCAP	STARD3	NA	NA	NA	NA	STARD3	41823	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	38170793	38171091	38171022	Y	CSF3	PSMD3,CSF3,THRA,MED24	NA	NA	NA	NA	CSF3	1179	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	38502716	38503032	38502793	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	39272	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	NA	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP4	77176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39654597	39654816	39654723	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	5141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	3372	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	7487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	40517094	40517456	40517393	Y	NA	STAT3	NA	NA	NA	NA	STAT3	21130	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	40559988	40560462	40560227	Y	RAMP2,CNP	STAT3,PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	13073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,RAMP2,VPS25,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	VPS25	18722	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	41686923	41687254	41687162	Y	NA	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	31935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	41847666	41848033	41847850	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	6323	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	43095998	43096402	43096133	Y	NA	NMT1,DCAKD	NA	NA	NA	NA	NMT1	30576	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	165950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	262720	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS3	19451	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB3	17869	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB3	17043	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB3	14932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	47312786	47313015	47312901	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,SPOP,PHOSPHO1	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	6658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	47929255	47929264	47929260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM117A	64713	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	49075036	49075414	49075227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG9	120812	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	49196679	49197214	49196965	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	453	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	54995280	54995673	54995559	Y	NA	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	55472969	55473349	55473111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	141757	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	56110025	56110231	56110193	Y	NA	VEZF1,SRSF1,DYNLL2	AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	SRSF1	27318	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	57833423	57834077	57833636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	50436	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr17	57877929	57878135	57878078	Y	YPEL2	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	38492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	59391895	59392060	59391978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	83197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	60745829	60746119	60745974	Y	TLK2	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	43067	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	60938326	60938715	60938420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	235564	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61431510	61431613	61431567	Y	STRADA,ACE	NA	MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	90126	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61779769	61779866	61779823	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	3237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62487438	62487665	62487534	Y	ICAM2	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	3489	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	62534383	62534677	62534525	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	32066	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62583721	62583959	62583840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	72227	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	62985207	62985536	62985392	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	15513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	64128284	64128318	64128301	Y	CEP112,CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	57884	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	268172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	37556	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	66817214	66817283	66817253	Y	NA	NA	ABCA8	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA8	132250	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	66818173	66818316	66818245	Y	NA	NA	ABCA8	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA8	131217	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	67095790	67095894	67095841	Y	NA	ABCA6	NA	NA	NA	NA	ABCA6	40135	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	67139403	67139524	67139506	Y	NA	ABCA6	NA	NA	NA	NA	ABCA6	3374	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	67172740	67173121	67172931	Y	NA	ABCA6	NA	NA	NA	NA	ABCA6	36711	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70188799	70188845	70188822	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	73638	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70335121	70335458	70335290	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	219960	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70398105	70398184	70398145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	223186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	217484	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70412502	70412837	70412669	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	208533	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70421948	70422074	70421986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	199296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	71499846	71500069	71499928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	193532	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	73691946	73692277	73692043	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	23131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3,RNF157	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF157	13768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr17	75160724	75161106	75160798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	79926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	321249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	75883563	75884329	75884163	Y	TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TMC6	242159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC6	171692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	9.48228274642966
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC6	170169	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	36737	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	79360	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	79789691	79790066	79789800	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	126640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1P1	95844	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	3490071	3490183	3490142	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	80465	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	3509218	3509430	3509419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99612	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	655312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9707499	9707519	9707509	Y	NA	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	1337	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	9742767	9742849	9742828	Y	VAPA,RAB31	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	36605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76	NA	NA	NA	NA	CEP76	21339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	12808880	12809062	12808971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	108104	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	12837862	12838421	12838235	Y	PTPN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	89221	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	NA	NA	NA	NA	NA	NPC1	63810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	63897	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	22043448	22044004	22043747	Y	NA	IMPACT	NA	NA	NA	NA	IMPACT	38868	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSC2	1934842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr18	33042221	33042422	33042327	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	33533	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	34047658	34047774	34047716	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	171981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	34052267	34052344	34052306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHOD3	176590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	39540677	39540940	39540809	Y	NA	PIK3C3	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	7506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	100970	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	45417757	45417861	45417809	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	37654	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	46519156	46519437	46519250	Y	DYM,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	455739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	46582084	46582553	46582428	Y	SMAD7,DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	403164	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	47250062	47250416	47250239	Y	NA	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	87914	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	3687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	52490491	52490717	52490508	Y	RAB27B	NA	RAB27B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB27B	107400	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	52504794	52504822	52504808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	119917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	53167517	53167871	53167822	Y	TCF4	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	542778	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	59968434	59968761	59968590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1468	115943	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	60857192	60857346	60857314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	128015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	60859734	60859973	60859925	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	125388	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	60984165	60984609	60984519	Y	BCL2	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	BCL2	752	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	66373953	66374204	66374079	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	6242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr18	68100758	68101139	68100949	Y	NA	NA	RTTN,SOCS6,CCDC102B	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	146621	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	68196083	68196104	68196093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	241946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	71777290	71777591	71777505	Y	NA	FBXO15,TIMM21	NA	NA	NA	NA	FBXO15	35509	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74755425	74755811	74755618	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	222862	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	236092	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	74780243	74780707	74780579	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	247680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74783964	74784198	74784017	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	251401	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74802146	74802233	74802190	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	269583	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	270996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	280798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74814335	74814742	74814712	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	281772	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	74815308	74815668	74815588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	282745	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr18	74816269	74816488	74816400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	283706	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr18	74818309	74818676	74818510	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	285746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr18	74840794	74841428	74841367	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	308231	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	309342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	76498631	76498821	76498726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	328464	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	77715299	77715635	77715515	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	5635	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD	NA	NA	NA	NA	MIR3187	12073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	5139337	5139604	5139434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	136141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	6071128	6071397	6071200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	94975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	7254620	7254884	7254780	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	37161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	8638437	8638868	8638608	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	34752	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	2805	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	OLFM2	NA	NA	NA	NA	OLFM2	11008	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	11679134	11679427	11679281	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ZNF627	10945	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	13143095	13143350	13143204	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	38673	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	11491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	14126359	14126500	14126444	Y	NANOS3,IL27RA	RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	10508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	14229419	14229865	14229637	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	PRKACA	2523	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F2	62057	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	16445319	16445495	16445399	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	11691	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	16462018	16462188	16462137	Y	CIB3	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	28390	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	17188668	17188879	17188834	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	4077	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	17249466	17249780	17249541	Y	FAM129C,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	64875	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	13055	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	18393747	18393881	18393780	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	MIR3188	2860	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	18588665	18588964	18588926	Y	NA	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ISYNA1	41554	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	18614213	18614397	18614285	Y	IL12RB1,JUND,LRRC25,ELL	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	16540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	23425915	23426300	23426108	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	4892	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	28234447	28234748	28234598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467700	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	28244004	28244439	28244017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1458009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	30752250	30752526	30752388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	339699	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	33541924	33542310	33542117	Y	NA	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	11484	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	34746041	34746169	34746166	Y	KIAA0355	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	2599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	36020756	36020837	36020796	Y	NA	TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	13660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	UPK1A-AS1	31058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	36437886	36438022	36437944	Y	GAPDHS,ETV2,WDR62	NFKBID,LRFN3,SDHAF1	NA	NA	NA	NA	LRFN3	13626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569,ZNF793	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	38490005	38490506	38490269	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	94137	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	FBL	NA	NA	NA	NA	FBL	19506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,CD79A,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	CD79A	385	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	59077	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr19	47611153	47611400	47611382	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	47926520	47926706	47926665	Y	NA	MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	5740	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	SLC17A7	19141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	50271422	50271787	50271602	Y	NA	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	3197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	51815926	51816289	51816251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFB	51383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	54049099	54049989	54049424	Y	ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	80110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,AC008753.6,PRKCG,CACNG7	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	3374	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	46108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	58217187	58217439	58217313	Y	NA	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	25850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	58784706	58785064	58784920	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	NA	NA	NA	NA	ZNF8	3254	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	MGC2752	3527	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	1046711	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	8627879	8628725	8628434	Y	NA	NA	LOC339788,LOC100506274,LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	188250	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	9428594	9428712	9428653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	83700	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10489892	10489997	10489924	Y	HPCAL1	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	48877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	11977030	11977330	11977180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	161309	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	12309855	12310149	12310048	Y	LPIN1	NA	TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	494134	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr2	15594564	15594826	15594695	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	104628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	17967823	17967867	17967845	Y	MSGN1	GEN1,SMC6	NA	NA	NA	NA	SMC6	11642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	19273463	19273583	19273517	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	282831	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	91487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	20356621	20356779	20356666	Y	NA	NA	SDC1,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	SDC1	66415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	24535588	24535972	24535848	Y	NA	RPL36AP13,ITSN2	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	19409	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	27194386	27194503	27194476	Y	NA	MAPRE3	NA	NA	NA	NA	MAPRE3	2906	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	28182324	28182658	28182394	Y	FOSL2,GCKR,RBKS	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	70359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	28953773	28954089	28953931	Y	NA	PPP1CB	PLB1,PPP1CB	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	18417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37815586	37815764	37815605	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	147847	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	38007638	38007650	38007644	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44027	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	38380770	38381135	38380953	Y	CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	45726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	318920	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	43364025	43364471	43364316	Y	ZFP36L2,THADA,THADA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	87277	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	44542790	44543096	44543052	Y	SLC3A1	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	43905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	45405025	45405418	45405218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	183473	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	45968952	45969144	45969027	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	92468	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	46125185	46125467	46125284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	248701	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALM2	97966	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	48584014	48584658	48584325	Y	FBXO11,FOXN2	FOXN2	NA	NA	NA	NA	FOXN2	44238	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	54236341	54236719	54236530	Y	NA	ACYP2,PSME4	PSME4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	40364	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	54682152	54682577	54682442	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	730	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	54977564	54977711	54977648	Y	TSPYL6,C2orf73	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	296142	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	55248216	55248544	55248355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	89213	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	61353902	61353922	61353912	Y	NA	C2orf74,AHSA2	NA	NA	NA	NA	C2orf74	16321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.16295340087156
chr2	62693263	62693492	62693331	Y	NA	TMEM17	EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	43537	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr2	62803591	62803729	62803643	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	66562	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	65430351	65430659	65430505	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	ACTR2	IMR90	Hi-C	24141950	AC007318.5	214	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	69981246	69981481	69981365	Y	MXD1	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	73293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	73404053	73404270	73404162	Y	EGR4	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	22204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	74060180	74060503	74060342	Y	NA	STAMBP	NA	NA	NA	NA	STAMBP	6094	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	75011329	75011355	75011342	Y	NA	AC007387.2,HK2	NA	NA	NA	NA	AC007387.2	31383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	39739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	77555136	77555510	77555330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	457998	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	79739044	79739283	79739164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	648978	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	85171560	85171874	85171659	Y	NA	TMSB10,KCMF1	KCMF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCMF1	24342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	85398234	85398633	85398390	Y	NA	TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	39701	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	87019569	87019949	87019758	Y	CD8B,CD8A,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	73324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	11742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	111005	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	99551773	99552038	99551906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf15	203910	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	100026434	100026453	100026444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC9	71269	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	28812	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	102711352	102711649	102711577	Y	IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	IL1R1	IL1R2,MAP4K4,IL1RL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	32348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	102874948	102875482	102875196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL18R1	50507	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	112420062	112420336	112420200	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	219931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	113450750	113451037	113450852	Y	NA	SLC20A1,NT5DC4	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5DC4	26026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CKAP2L	31530	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	55962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	113583112	113583470	113583291	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	62858	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	113969874	113970195	113970111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASH2P	369469	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	256849	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.70040302299694
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	213143	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	206734	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	72938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	NA	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	RALB	499595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFCP2L1	415703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC013399.3	67020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	122298770	122299123	122298947	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	12313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	128773511	128773726	128773583	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	9968	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	136242341	136242686	136242514	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	44120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	136963288	136963406	136963338	Y	UBXN4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	221618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153261807	153262193	153261950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	72056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153263916	153264284	153263950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	74165	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153318771	153319092	153318943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	129020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153347389	153347769	153347704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	157638	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	158687871	158687996	158687910	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	42378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4785	197513	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	161065805	161066369	161066265	Y	CD302	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4785	196024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	161080666	161080905	161080769	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR4785	181488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	163222961	163223077	163223019	Y	KCNH7,GCA	IFIH1	NA	NA	NA	NA	IFIH1	49748	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	IFIH1	1031485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	1377922	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	171540516	171540678	171540597	Y	NA	NA	MYO3B	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2S2P4	65543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	172287168	172287529	172287349	Y	TLK1	DCAF17,METTL8	NA	NA	NA	NA	DCAF17	1198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	173044114	173044391	173044220	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	78486	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	173796243	173796588	173796342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	198241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	209841	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	175753579	175753941	175753870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	171074	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	178030872	178031290	178031011	Y	NFE2L2,NFE2L2	HNRNPA3,AC079305.8	HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	44001	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	189957665	189957918	189957859	Y	COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	84687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	189978697	189979080	189978901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	63525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	189987614	189988000	189987838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	54605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	189994721	189995040	189994923	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	47565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	27453	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	190025289	190025449	190025364	Y	COL3A1	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	17156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr2	190075572	190075716	190075672	Y	DIRC1	COL5A2	COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	32967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	191512036	191512188	191512066	Y	INPP1,STAT1,GLS,NAB1	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	2564	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	68074	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	191825811	191826187	191826065	Y	NAB1,GLS,STAT1	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	57499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192717272	192717408	192717316	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	SDPR	7291	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192775335	192775569	192775423	Y	OBFC2A,SDPR	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	65354	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192839658	192840009	192839864	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	129677	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192870555	192870805	192870799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	160574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	205589	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	193122230	193122619	193122425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	412249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	1432402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	196278119	196278504	196278172	Y	NA	AC064834.1	SLC39A10	IMR90	Hi-C	24141950	AC064834.1	32752	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	18.733290303922
chr2	196400983	196401214	196401085	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC39A10	37487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	196425923	196426330	196426251	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	12371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	196427777	196428076	196427925	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	10625	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	196531201	196531576	196531334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	92500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	197686451	197686687	197686569	Y	PGAP1,C2orf66	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	24002	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	198328385	198328433	198328409	Y	PLCL1	SF3B1,COQ10B,HSPE1,MOB4	NA	NA	NA	NA	COQ10B	12238	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	200675242	200675584	200675389	Y	NA	FTCDNL1	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	38312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201238754	201239056	201238905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	70150	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201268506	201268867	201268734	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	99902	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	202109391	202109622	202109507	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	13225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	203292079	203292309	203292231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	52420	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	203935433	203935668	203935572	Y	NBEAL1	NA	NA	NA	NA	NA	NBEAL1	57831	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	204393119	204393487	204393303	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	4646	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	204646981	204647288	204647136	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	248848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	204664765	204664819	204664792	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	266632	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	204672850	204673169	204672900	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	274717	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	GPR1	NA	NA	NA	NA	GPR1	3982	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	207348794	207348941	207348896	Y	NA	ADAM23	NA	NA	NA	NA	ADAM23	42531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	208484440	208484730	208484623	Y	PLEKHM3,CREB1,METTL21A,METTL21A	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	3922	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	210046809	210047163	210046986	Y	MAP2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	239619	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	211406237	211406446	211406310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	65861	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	212315975	212316294	212316135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	975599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	IKZF2	NA	NA	NA	NA	IKZF2	37890	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	221000091	221000153	221000122	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A3	510042	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC4A3	603383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	222376122	222376296	222376209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	60626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr2	223439256	223439394	223439332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	79662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	224773224	224773437	224773430	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	34667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	224774056	224774145	224774098	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	33959	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	225340678	225341017	225340847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	107093	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	226858171	226858617	226858345	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	189470	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr2	226859582	226859764	226859704	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	188323	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	226867162	226867478	226867316	Y	NA	NA	IRS1,COL4A4,RHBDD1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	180609	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	226895670	226896158	226895921	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	151929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	226983188	226983709	226983518	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	64378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	226985613	226985988	226985800	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	62099	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	226986846	226987128	226987011	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	60959	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	227048517	227048542	227048530	Y	NA	AC068138.1	NA	NA	NA	NA	AC068138.1	430	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	227292366	227292516	227292441	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,RHBDD1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	244279	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	227508782	227509042	227508912	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	153433	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	227822351	227822632	227822559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	124054	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230172024	230172330	230172167	Y	PID1	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	38023	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230266271	230266485	230266374	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	132270	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230273717	230274042	230273951	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139716	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230274489	230274615	230274507	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	140488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr2	230275750	230275810	230275797	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	141749	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	232026724	232026986	232026907	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	34274	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	232106599	232106881	232106746	Y	B3GNT7	ARMC9,AC018738.2	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	11929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr2	233563344	233563704	233563468	Y	NA	GIGYF2	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	3335	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	130399	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	234882556	234882776	234882660	Y	TRPM8	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	121344	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	235160532	235160873	235160730	Y	NA	NA	TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	242824	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	235166155	235166362	235166255	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8,ARL4C,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	237335	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	237246448	237246491	237246461	Y	IQCA1	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	171436	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	238016795	238017153	238016975	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	24335	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	238292882	238293292	238292932	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	27726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	238321382	238321708	238321611	Y	COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	364	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	AC112721.1,AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr2	238382776	238383011	238382901	Y	LRRFIP1	AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	9060	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	RAB17,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	RAB17	565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	238585463	238585872	238585569	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	51244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	240248408	240248826	240248656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	72304	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	22056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242425566	242425726	242425646	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	21419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr2	242702443	242702859	242702736	Y	ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	30449	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	321375	321752	321587	Y	NA	ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3	NA	NA	NA	NA	NRSN2	3674	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	1259137	1259285	1259212	Y	C20orf46,C20orf202	SNPH	NA	NA	NA	NA	SNPH	14177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	2671963	2672026	2672004	Y	NA	NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,EBF4	NA	NA	NA	NA	EBF4	439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	2978820	2979208	2979015	Y	NA	MRPS26	NA	NA	NA	NA	MRPS26	45383	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	3286864	3286977	3286928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A11	69028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	3348660	3349006	3348744	Y	FASTKD5,UBOX5,GFRA4	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	37266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	4637167	4637289	4637235	Y	NA	RPS4XP2,PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	27593	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	4646656	4646942	4646731	Y	RASSF2,SLC23A2,RASSF2,PRNP,PRNP	RPS4XP2,PRNP	ADRA1D,PRNP,PRND,RASSF2,SLC23A2,C20orf30,PRNT	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	17940	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP,PRND	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	5072801	5072926	5072885	Y	NA	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	32346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	5610913	5611049	5610981	Y	NA	GPCPD1	GPCPD1,C20orf196	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	21241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	7978054	7978163	7978110	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	20313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	9291356	9291748	9291412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP25	905730	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	10447085	10447351	10447236	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	34215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	10472654	10473100	10472965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	59784	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	17519291	17519778	17519563	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	28087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25305115	25305524	25305270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	64095	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	170704	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	29650599	29650997	29650932	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	30613136	30613382	30613302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRG1	75241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	31069966	31070213	31070090	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	100663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	6916	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	34356129	34356371	34356208	Y	SPAG4,CPNE1,RBM39,SCAND1,PHF20	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	1525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35616902	35617278	35617001	Y	GHRH,RBL1,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	38656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	35905068	35905696	35905172	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL	MANBAL	RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B	IMR90	Hi-C	24141950	MANBAL	10345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	36008343	36008504	36008424	Y	SAMHD1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	37255	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	36550208	36550483	36550346	Y	NNAT,VSTM2L	VSTM2L	NA	NA	NA	NA	VSTM2L	20709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	39631777	39632207	39632178	Y	NA	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	23251	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	42381187	42381490	42381296	Y	C20orf111	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	87433	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	42554497	42554746	42554685	Y	IFT52,TOX2	NA	NA	NA	NA	NA	JPH2	259472	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	42809563	42809791	42809669	Y	FITM2,JPH2	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	JPH2	4427	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	42955373	42955435	42955404	Y	NA	FITM2	NA	NA	NA	NA	FITM2	17564	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	DNTTIP1	8072	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	34622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48411231	48411773	48411549	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,ZNFX1,ZNFX1-AS1,PTGIS,RNF114	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	15477	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48810888	48811172	48811109	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	5512	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48837485	48837796	48837570	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32109	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48838079	48838414	48838219	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr20	49047228	49047674	49047434	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	77217	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	170758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr20	52212842	52213180	52212942	Y	ZNF217	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52213211	52213282	52213247	Y	NA	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11164	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52351984	52352361	52352104	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	127538	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52353948	52354213	52354172	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	129502	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52489475	52489586	52489523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	265029	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	290284	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr20	52516053	52516507	52516332	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	291607	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	287865	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	278815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52547344	52547891	52547567	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	274495	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	52550838	52551665	52551067	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	270721	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	256247	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr20	52743384	52744045	52743713	Y	NA	NA	DOK5,PTPRT,SULF2,CYP24A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	78341	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	55014874	55015273	55015037	Y	CASS4,CASS4,C20orf43	AURKA,CSTF1	NA	NA	NA	NA	CSTF1	49447	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	4345	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	58621223	58621546	58621377	Y	PHACTR3,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	107871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	33351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	17104761	17105053	17104812	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	4417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	20089064	20089357	20089211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37P3	824262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	27809790	27810078	27809885	Y	NA	AP001597.1	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	45836	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.39422858980887
chr21	30591516	30591874	30591674	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	27124	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	30631059	30631204	30631132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	66667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	34818143	34818502	34818323	Y	OLIG2,OLIG1	IFNGR2,TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	31816	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr21	35397758	35397925	35397838	Y	NA	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334,LINC00310,FAM165B,KCNE2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	45599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr21	36167928	36168243	36168166	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	182487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36203156	36203348	36203246	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	217715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	235308	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36223731	36223900	36223856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	238290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36349860	36350141	36349984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	364419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36379576	36379916	36379746	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	394135	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36511746	36511757	36511752	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,SETD4	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	526305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	36599466	36599950	36599803	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	614025	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	38629602	38630247	38630025	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	8015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr21	41003318	41003469	41003395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	187537	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	43331076	43331447	43331406	Y	NA	PRDM15,C2CD2	NA	NA	NA	NA	PRDM15	33485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	43641830	43642232	43641888	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	24031	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	48319	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	47935050	47935239	47935141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2A	58238	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	17568441	17568522	17568513	Y	NA	IL17RA,CECR6	NA	NA	NA	NA	IL17RA	4597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	17726337	17726494	17726401	Y	CECR2,BCL2L13,IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	54511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	177574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	20886351	20886470	20886411	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	38151	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	23725705	23725832	23725738	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	17081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	24184973	24185254	24185128	Y	C22orf43	SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	SLC2A11	11636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	24878539	24879065	24878732	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	70406	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	29188218	29188399	29188309	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	6186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	30598549	30598642	30598596	Y	LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	42198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	30620211	30620567	30620379	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	20273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	9499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	SEC14L2	10711	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	32291389	32291694	32291650	Y	RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5	YWHAH	NA	NA	NA	NA	YWHAH	46753	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	RP1-90G24.10	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-90G24.10	15949	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	397020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOL6	58627	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	37585028	37585323	37585113	Y	NA	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	8102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	39154682	39154985	39154835	Y	APOBEC3G,APOBEC3D,JOSD1,SUN2,SUN2	SUN2,DNAL4	NA	NA	NA	NA	SUN2	33163	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	39854172	39854554	39854368	Y	CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3	NA	NA	NA	NA	NA	ATF4	59146	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	40781478	40781596	40781515	Y	NA	ADSL,SGSM3	NA	NA	NA	NA	SGSM3	16883	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	44856761	44856923	44856842	Y	NA	LDOC1L	PARVB,PARVG,SAMM50,KIAA1644,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	35255	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	46408022	46408110	46408057	Y	NA	C22orf26	NA	NA	NA	NA	C22orf26	39914	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	49157619	49157940	49157765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	1061220	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.39422858980887
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	50667232	50667412	50667320	Y	NA	TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	14009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr22	51109040	51109307	51109069	Y	SHANK3	ARSA,SHANK3	SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHANK3	1536	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	5063521	5063694	5063575	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	43875	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	8502863	8503141	8502998	Y	LMCD1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	500316	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	NA	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHCHD4	227194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15675662	15676068	15675826	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	34324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	16181971	16182303	16182167	Y	GALNTL2	NA	GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	122176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	851119	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	953048	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	23709947	23710120	23710034	Y	UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	135274	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2,EOMES	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	42894	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	33554713	33555077	33554895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	73850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	46756	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	40491258	40491489	40491375	Y	NA	ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619	NA	NA	NA	NA	ENTPD3-AS1	1331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	42002407	42002746	42002471	Y	ULK4	ULK4	NA	NA	NA	NA	ULK4	485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	46149662	46149840	46149763	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	114346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	52532822	52533186	52532863	Y	TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1	NISCH,NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	33884	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	186035	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	60064522	60064780	60064643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	1170353	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	66279224	66279373	66279285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	161939	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	66295672	66296073	66295873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	178387	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	67741334	67741732	67741533	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	38213	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	72388262	72388804	72388511	Y	RYBP	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	105265	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	72545339	72545749	72545633	Y	NA	NA	LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	51270	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	81530456	81530494	81530475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	278818	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	85318532	85318917	85318639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	312400	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	98681428	98681771	98681644	Y	DCBLD2	NA	MIR548G,COL8A1,DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD2	62895	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	422284	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	398108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	395016	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	99664130	99664284	99664246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	313560	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	100088429	100088702	100088566	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	LNP1	29335	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	107376610	107376921	107376801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	136827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	107707360	107707957	107707585	Y	CD47	NA	MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	99915	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	112076380	112076550	112076391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	202006	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	119369915	119370223	119370069	Y	NR1I2	RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	16918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	119758013	119758347	119758179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	52917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	119872160	119872510	119872343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	60418	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	121474851	121475213	121475072	Y	NA	GOLGB1	GOLGB1	K562	ChIA-PET	22265404	GOLGB1	8249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	122208819	122209075	122208974	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	22717	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	122476470	122476801	122476636	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	33870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	122485125	122485355	122485240	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	25316	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	124714923	124714954	124714939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	57848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	128304030	128304455	128304163	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	NA	GATA2,SEC61A1,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,C3orf27	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPN1	93463	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr3	128589304	128589705	128589400	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	6734	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	128831103	128831496	128831287	Y	NA	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	8148	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	129344975	129345039	129344984	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	21314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	134206320	134206511	134206427	Y	CEP63,CEP63,CEP63	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	2762	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	134286307	134286601	134286455	Y	CEP63,CEP63,CEP63	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC13	82749	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	6.24443010130734
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141133650	141133961	141133787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	69928	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	20024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	300659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	148361521	148361616	148361569	Y	NA	NA	ZIC4	IMR90	Hi-C	24141950	GYG1	345512	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	148864917	148865175	148865046	Y	NA	HPS3	NA	NA	NA	NA	HPS3	19546	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	148899476	148899525	148899501	Y	AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP	CP	NA	NA	NA	NA	CP	38317	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149108520	149108892	149108690	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	14868	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149225895	149226130	149226044	Y	RNF13	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	15448	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149271786	149271997	149271800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	61339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149333585	149333911	149333859	Y	TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	118590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149339543	149339560	149339552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	112941	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	149933925	149934322	149934006	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFN2	167350	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	151996540	151996946	151996646	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	11196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	152962900	152963082	152962951	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	84871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	152965278	152966000	152965593	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	87249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	153002176	153002347	153002282	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	124147	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	153007263	153007499	153007331	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	129234	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	153017510	153017568	153017539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2B	139481	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	153037837	153038182	153037892	Y	RAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2B	159808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	156356152	156356341	156356222	Y	NA	TIPARP,TIPARP-AS1	LOC339894	IMR90	Hi-C	24141950	TIPARP	32683	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	157019065	157019219	157019119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550I24.2	128053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	157249695	157249901	157249798	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	287	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	239028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	159597816	159598076	159597925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	106461	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	72930	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	170137645	170137870	170137713	Y	SLC7A14,CLDN11,CLDN11	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	2992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr3	170138195	170138413	170138223	Y	NA	CLDN11	NA	NA	NA	NA	CLDN11	3542	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2	NA	NA	NA	NA	ECT2	43612	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	738842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr3	182973152	182973434	182973425	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	93525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	98481	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	101290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	183086947	183087263	183087034	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	57303	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	184503800	184503841	184503824	Y	NA	VPS8	VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD	IMR90	Hi-C	24141950	VPS8	24090	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	199839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	77293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	187673173	187673416	187673302	Y	RTP2,BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	195656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188002342	188002742	188002584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	132497	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188035801	188035961	188035890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	165956	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188109949	188110178	188110065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	240104	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188405130	188405536	188405435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	257467	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188826947	188827206	188827077	Y	NA	NA	BCL6,LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	TPRG1	163944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	188993718	188993931	188993836	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	330715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	21.0460421932951
chr3	188995616	188995876	188995738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	332613	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189006455	189006689	189006536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	343452	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	359374	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189025742	189026175	189025816	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	362739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.70040302299694
chr3	189029389	189029728	189029564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	366386	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	189034066	189034494	189034299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	371063	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189111445	189111690	189111608	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	448442	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	189134489	189134632	189134561	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	471486	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr3	189192792	189192813	189192806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	529789	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	189240469	189240487	189240479	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	577466	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr3	189503725	189504099	189503909	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	334127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr3	189557440	189557782	189557660	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	280444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	189559377	189559697	189559485	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	278529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	189569925	189569928	189569927	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	268298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189628932	189629095	189629014	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	209131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	205296	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	191160044	191160233	191160139	Y	PYDC2	NA	FGF12	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC50	115178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	196757369	196757726	196757658	Y	LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	2682	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr3	196948967	196949228	196949097	Y	NA	NA	MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	74943	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	2355187	2355295	2355232	Y	NAT8L,ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	63095	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	2389037	2389223	2389089	Y	LOC402160	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	29167	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	7999396	7999553	7999475	Y	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	59743	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB28	201297	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	13486596	13486918	13486821	Y	BOD1L,RAB28	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	2607	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15533007	15533164	15533086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	63518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15536628	15536631	15536630	Y	NA	NA	FBXL5	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	67139	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	17979858	17980211	17980206	Y	CLRN2,LCORL	LCORL	NA	NA	NA	NA	LCORL	41288	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC149	139068	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	25097730	25097880	25097805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPSECS	62324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	25402341	25402497	25402460	Y	NA	ANAPC4	NA	NA	NA	NA	ANAPC4	25506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	26338276	26338542	26338322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPJ	175199	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	2662843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr4	35027106	35027343	35027234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	2658655	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	19.1958406817966
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	39935708	39936100	39935904	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	41476	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	40519982	40520039	40520011	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	463536	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	57048653	57048701	57048677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	171600	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	61223497	61223597	61223547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN3	841379	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	LPHN3	NA	NA	NA	NA	LPHN3	3823	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	62960686	62960903	62960795	Y	NA	RP11-84A1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-84A1.1	8864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	68394565	68394648	68394607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	170249	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	68487662	68488005	68487834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	76892	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	68538149	68538306	68538215	Y	NA	UBA6,UBA6-AS1	NA	NA	NA	NA	UBA6	26591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74545430	74545943	74545736	Y	CXCL6,CXCL1	NA	CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,PF4	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	58280	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74549349	74549563	74549470	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	NA	CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	54660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74570970	74571346	74571160	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	32877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	74575200	74575450	74575368	Y	ANKRD17,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	28773	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74581765	74581937	74581894	Y	ANKRD17,IL8	IL8	MTHFD2L,CXCL3	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	22286	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74584369	74584648	74584565	Y	ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	MTHFD2L,CXCL3	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	19575	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74588737	74589023	74588915	Y	ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	15200	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr4	74740201	74740473	74740311	Y	IL8,PPBP,PF4,EREG,CXCL3,CXCL2,PF4V1	CXCL6,CXCL1	NA	NA	NA	NA	CXCL1	7091	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74881912	74882135	74882023	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL5,CXCL3	NA	NA	NA	NA	CXCL5	19416	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74961952	74962121	74962037	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL2,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	CXCL2	889	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr4	75257879	75258118	75257951	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	29019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.62550377874618
chr4	75411825	75412170	75412032	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	182965	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	75539265	75539284	75539274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTC	178612	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr4	75545554	75545864	75545679	Y	NA	NA	EREG,EPGN,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTC	172032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	75550011	75550323	75550221	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTC	167573	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	75554137	75554451	75554233	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	163445	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	22.433693326919
chr4	75556698	75556816	75556809	Y	EREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	161080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	159561	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr4	77222590	77222809	77222671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM47E	89397	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	77868010	77868840	77868612	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	16	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	81048415	81048773	81048660	Y	ANTXR2,PRDM8	ANTXR2	PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	3807	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	81056560	81056903	81056754	Y	ANTXR2	ANTXR2,PRDM8	PRDM8	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	11952	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	81139161	81139412	81139241	Y	NA	PRDM8	NA	NA	NA	NA	PRDM8	36128	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	33.5349023959098
chr4	81228486	81228584	81228534	Y	NA	C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	26290	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	81392904	81393098	81393001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf22	138030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	85668684	85668904	85668818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	216634	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	87920181	87920277	87920229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	50905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	89377235	89377564	89377513	Y	HERC6,HERC5	HERC5	NA	NA	NA	NA	HERC5	967	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	93103612	93103785	93103627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2022977	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	102254048	102254281	102254164	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	12656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	108430904	108430932	108430918	Y	SGMS2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	208676	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	113172339	113172711	113172527	Y	NEUROG2	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	AP1AR	21446	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	113965904	113966103	113966018	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	228639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	114023484	114023505	114023495	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	286219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	114108421	114108816	114108556	Y	ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	230663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	50831	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	120093482	120093688	120093586	Y	NA	USP53	NA	NA	NA	NA	USP53	38054	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	124364843	124364989	124364898	Y	SPRY1	SPRY1	SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY1	48893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	129834414	129834678	129834574	Y	PHF17,SCLT1,C4orf33,C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	177794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	131958409	131958454	131958432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1945645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	141287573	141287758	141287638	Y	NA	RP11-425I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-425I13.1	1558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	143059861	143060134	143059998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	706451	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	490107	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	428429	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	149364278	149364693	149364534	Y	NR3C2	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NR3C2	428	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	152582106	152582499	152582283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PET112	97676	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	109080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	154235645	154236052	154235798	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	27749	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	157692679	157692824	157692748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	197722	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	157866755	157867028	157866930	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	23518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	157869778	157870097	157870082	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	20449	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	157889828	157890031	157889884	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	177699134	177699410	177699361	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	12471	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	177705907	177706270	177706189	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	5611	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	177824075	177824477	177824359	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	112194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr4	179336968	179337246	179337206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	975311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	181045421	181045488	181045454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	2683764	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	184888585	184888733	184888700	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	STOX2	116001	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	NA	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	162156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	671573	671920	671762	Y	TPPP	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	19590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr5	1022145	1022187	1022166	Y	SLC6A18,NKD2	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	15201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	1478329	1478968	1478499	Y	LPCAT1	LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	43124	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	14037561	14037744	14037653	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94909	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP4P1	655292	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	2037529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	32083300	32083310	32083305	Y	PDZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	89146	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	32582779	32582965	32582856	Y	SUB1	NA	ZFR,SUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUB1	53040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPBL	154757	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	38546436	38546759	38546707	Y	NA	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	8904	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	NA	NA	NA	NA	NA	SEPP1	419175	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	44875784	44875973	44875831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	68757	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	56784239	56784594	56784302	Y	GPBP1,ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	316464	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr5	56790461	56790772	56790742	Y	NA	NA	ACTBL2,PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	322686	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	57076259	57076553	57076406	Y	NA	NA	PLK2,GPBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPBP1	608484	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	57111915	57112364	57112128	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	641723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	57112814	57113117	57112881	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	640970	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr5	57117655	57118000	57117917	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	636087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	632791	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr5	57137483	57137861	57137645	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	616226	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	57389991	57390128	57390060	Y	NA	NA	PLK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLK2	363959	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	57537303	57537570	57537449	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	216517	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	57542411	57542665	57542608	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	211422	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-266N13.2	87531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	61661747	61661797	61661772	Y	NA	DIMT1,IPO11	NA	NA	NA	NA	DIMT1	35969	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr5	68823946	68824105	68824026	Y	NA	OCLN	NA	NA	NA	NA	OCLN	37827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	71645321	71645550	71645377	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	30848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	97865	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	72670335	72670728	72670600	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	71624	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR,CTD-2235C13.2	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	77883814	77884068	77883938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	179776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	78411121	78411135	78411130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	118726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	78429598	78429944	78429771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	99917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	78525358	78525750	78525524	Y	NA	DMGDH,JMY	NA	NA	NA	NA	DMGDH	4111	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	79376408	79376431	79376418	Y	THBS4	NA	NA	NA	NA	NA	MTX3	91326	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	80026504	80026674	80026589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	77702	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	41796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	90765478	90765836	90765795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	88302	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	91949366	91949620	91949441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-529L17.2	72341	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.55060453449541
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	94072643	94072953	94072798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	120334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	97446063	97446328	97446197	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	97643613	97643769	97643691	Y	NA	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	28679	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	97650049	97650331	97650134	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	22117	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	102121468	102121525	102121497	Y	PPIP5K2	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	33783	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	102728995	102729017	102729006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf30	136592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	103273913	103274153	103274008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	377419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	106725486	106725757	106725607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	278839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	106906858	106907181	106907119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	115412236	115412448	115412328	Y	NA	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	6240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	118399353	118399657	118399513	Y	NA	DMXL1,CTB-161M19.4	DMXL1	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-161M19.4	4928	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	118734927	118735157	118735058	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	50981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	124593106	124593253	124593226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	450180	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	125686848	125687181	125687011	Y	GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3,ALDH7A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	6643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	125694238	125694550	125694409	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	414	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	125709518	125709709	125709633	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	15694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	130750368	130750574	130750471	Y	CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	171182	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	131015627	131015946	131015841	Y	FNIP1,CDC42SE2	RAPGEF6	RAPGEF6	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF6	46698	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	131641002	131641297	131641050	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	11994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	131800033	131800450	131800090	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	24040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	132368718	132369095	132368932	Y	AFF4,ZCCHC10	ZCCHC10,HSPA4	ZCCHC10,HSPA4,AFF4	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZCCHC10	8422	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	133463152	133463566	133463254	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	14750	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	133880902	133881116	133881009	Y	PCBD2,CDKL3,PHF15	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	40659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	137001251	137001596	137001494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	86443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	SPATA24	NA	NA	NA	NA	SPATA24	10439	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	139568486	139568801	139568644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	83124	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	139641396	139641769	139641570	Y	SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	38937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	CTC-329D1.3,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	141684732	141684818	141684775	Y	PCDH1,SPRY4	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	AC005592.2	18040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	141706626	141706892	141706857	Y	NA	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	SPRY4	2606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr5	141769483	141770003	141769555	Y	NA	NA	SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	65463	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	141805995	141806051	141806008	Y	NA	NA	SPRY4,FGF1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	101975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr5	141818179	141818493	141818304	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	114159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.70040302299694
chr5	141824245	141824298	141824272	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	120225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.55060453449541
chr5	141826368	141826739	141826520	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	122348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	141844342	141844631	141844489	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	140322	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	141948217	141948584	141948420	Y	NA	NA	SPRY4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP26	199365	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	141952319	141952649	141952484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	195300	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	142697698	142698151	142698028	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	12019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	144920892	144921143	144921082	Y	NA	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	291789	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	145499175	145499563	145499369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	60660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr5	148664486	148664850	148664668	Y	NA	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	15052	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	149111957	149112473	149112231	Y	AFAP1L1,IL17B,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	4096	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	150505089	150505277	150505181	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6	TNIP1,ANXA6	TNIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA6	30166	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	153862086	153862603	153862319	Y	NA	SAP30L	HAND1,FAM114A2,MFAP3,LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	38569	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	155202123	155202494	155202309	Y	NA	NA	PPP1R2P3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	883493	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	159837617	159837836	159837727	Y	NA	C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	SLU7	8882	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	172167900	172168183	172168030	Y	UBTD2,DUSP1	DUSP1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	28015	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	172710965	172711353	172711102	Y	NA	NA	ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-5	50605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	174194382	174194672	174194467	Y	NA	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	44846	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP148	294164	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5A	101896	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	179188972	179189165	179189138	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	MAML1	31121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	179496781	179497164	179497079	Y	HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	542839	543066	543064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	148051	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	2377151	2377429	2377354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	133169	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	2763251	2763536	2763387	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	2901720	2902211	2901908	Y	NA	SERPINB9	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	206	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	2980500	2980669	2980575	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NQO2	5552	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	2992078	2992424	2992251	Y	NA	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	NA	NA	NA	NA	NQO2	5857	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3072108	3072295	3072201	Y	NA	RIPK1,BPHL	NA	NA	NA	NA	RIPK1	9883	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4,TUBB2B	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB2B	18098	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	126135	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	4931719	4931926	4931911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPP40	70371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	5031190	5031205	5031197	Y	NA	RPP40	RPP40	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPP40	28893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	5157743	5158129	5157936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	101043	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	749610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr6	6811454	6812228	6812086	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	293602	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	7126223	7126536	7126378	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	20393	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	8083649	8083837	8083720	Y	NA	EEF1E1	NA	NA	NA	NA	EEF1E1	16974	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	9454371	9454420	9454396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	963472	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	97330	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	10589491	10589864	10589781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	99035	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	11731641	11731862	11731736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	195703	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	11769423	11769725	11769659	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	233485	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr6	11772710	11773287	11772940	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	233708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	17948397	17948663	17948653	Y	NA	KIF13A	NA	NA	NA	NA	KIF13A	37191	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	19805542	19805809	19805569	Y	NA	RP4-625H18.2	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP4-625H18.2	2559	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRS2	98120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	25497718	25497827	25497789	Y	TRIM38	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	220412	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.62550377874618
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	236419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM27	174070	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	30175844	30176213	30176153	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2991	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	30735359	30735715	30735624	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,IER3	TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	25028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	31275830	31276119	31275994	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	29736	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	31529822	31530211	31530167	Y	HLA-B,STK19,HSPA1B,TNF,LST1	SNORD84,DDX39B,ATP6V1G2-DDX39B,NFKBIL1,ATP6V1G2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G2	15618	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	31942054	31942322	31942254	Y	NA	CFB,SKIV2L,STK19	NA	NA	NA	NA	STK19	5186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	ATF6B	17851	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	32819276	32819643	32819486	Y	HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	20028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	33781645	33781809	33781745	Y	LEMD2,LEMD2	LEMD2	IP6K3,LEMD2,LOC100507584,MIR1275,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,MLN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LEMD2	26732	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	35171617	35171779	35171698	Y	NA	NA	TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3,UHRF1BP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	52907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	39317410	39317439	39317426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	122184	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	40904550	40904902	40904649	Y	UNC5CL	NA	APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	133782	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	41153851	41154204	41154120	Y	TREML4,TREM1,NFYA	NA	NA	NA	NA	NA	TREM1	98253	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	41325588	41325600	41325594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TREM1	73131	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42204481	42204837	42204659	Y	TRERF1	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	20878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42361929	42362135	42362048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	55654	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	42515662	42516014	42516002	Y	GUCA1A,MEA1,KIAA0240	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	13786	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30636	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	44039522	44039890	44039644	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	499	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	44783475	44783845	44783660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	430213	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	45299904	45300369	45300004	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	45317803	45318343	45317888	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	25347	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	47041238	47041252	47041245	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF21	234389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	48785390	48785660	48785525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	643244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	53225493	53225821	53225675	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	13546	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	56103224	56103241	56103234	Y	COL21A1	NA	NA	NA	NA	NA	DST	714185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	520858	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	56459514	56459884	56459699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	357542	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	273520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	56578288	56578394	56578341	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	239032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	56594458	56594846	56594652	Y	NA	NA	DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	DST	222580	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	56730772	56731166	56730969	Y	NA	NA	PRIM2,BAG2,DST,BEND6	IMR90	Hi-C	24141950	DST	86260	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	303591	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	MIR30A	NA	NA	NA	NA	MIR30A	8093	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	MIR30A	NA	NA	NA	NA	MIR30A	7200	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	MIR30A	NA	NA	NA	NA	MIR30A	3049	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr6	72178822	72179167	72178995	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	67498	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72179171	72179414	72179328	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	67847	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72233830	72234188	72234009	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	122506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	183517	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	73329727	73330142	73329822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	640796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	75997264	75997445	75997280	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	4580	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	76367901	76367953	76367944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP6	58676	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	79753259	79753564	79753411	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	32389	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	80838245	80838506	80838365	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	23881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	81348599	81348680	81348638	Y	NA	NA	BCKDHB	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	534235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	82953012	82953093	82953052	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	2378	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	86175561	86175746	86175667	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	17752	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	88632431	88632870	88632722	Y	CNR1	NA	RNGTT	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	222504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	89473318	89473558	89473438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	197790	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	89577904	89578284	89578094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	93064	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	91134952	91135221	91135020	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	130325	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	95244699	95244909	95244803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	778510	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	101311437	101311450	101311446	Y	NA	ASCC3	NA	NA	NA	NA	ASCC3	15798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	61320	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	108972074	108972278	108972175	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	93036	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	109126872	109127260	109127066	Y	FOXO3,FOXO3,ARMC2	ARMC2	FOXO3,LINC00222	IMR90	Hi-C	24141950	ARMC2	40359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	111612312	111612528	111612438	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	33761	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	111744480	111744594	111744536	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	58120	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	111925507	111925888	111925538	Y	REV3L,TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	26	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	112125712	112126337	112125987	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	66318	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	112173257	112173622	112173448	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	19033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	112335734	112335952	112335843	Y	NA	NA	FYN,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	70780	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	112619942	112620186	112620045	Y	NA	NA	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	213210	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	113772353	113772409	113772395	Y	NA	NA	MARCKS,FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	404132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	123017370	123017507	123017435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	90808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	126108316	126108682	126108499	Y	NA	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	8009	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	127653585	127653894	127653740	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	8860	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	129822062	129822220	129822139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	207150	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	131595636	131595766	131595737	Y	MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	140830	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134608836	134609436	134609187	Y	SGK1,SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	27814	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	134609640	134610343	134609803	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	26907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	134620653	134620958	134620903	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	16292	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134636367	134636606	134636545	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	644	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134668918	134669336	134669288	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	31668	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.23785264512232
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134761528	134761869	134761739	Y	SGK1,SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	124278	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134838672	134838766	134838701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-557H15.4	140208	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134840674	134840895	134840768	Y	SGK1,SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-557H15.4	138079	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	134845573	134845660	134845628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-557H15.4	133314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.08805415662079
chr6	135231583	135231692	135231635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	190502	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	136788990	136789214	136789102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	80743	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	137227679	137227915	137227797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	85962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	138151863	138152166	138152043	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	34185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	139860975	139861228	139861133	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	139861409	139861802	139861629	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF3B5	732678	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	147516145	147516533	147516350	Y	NA	STXBP5	NA	NA	NA	NA	STXBP5	7028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	149469951	149470122	149470037	Y	NA	NA	TAB2	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	67655	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	154798068	154798417	154798243	Y	NA	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	31376	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	TIAM2	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	41990	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	158182288	158182636	158182583	Y	SNX9	NA	SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	59660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	158670119	158670409	158670245	Y	NA	NA	TULP4,TMEM181	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	82735	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	158702253	158702563	158702348	Y	TMEM181	NA	TMEM181,TULP4,SYTL3,GTF2H5,DYNLT1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	114869	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	159211450	159211647	159211549	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	26797	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	159461134	159461312	159461148	Y	DYNLT1,SYTL3,TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	41915	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	161571430	161571737	161571637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	121356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PACRG,PARK2	NA	NA	NA	NA	PACRG	47651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	163976539	163976874	163976679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	143507	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr6	165988383	165988522	165988473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf118	267287	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	166055438	166055636	166055513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf118	334342	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr6	166067204	166067448	166067238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00473	332088	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr6	167069842	167070191	167069884	Y	PRR18	NA	NA	NA	NA	NA	RNASET2	298488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASET2	253061	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	169473606	169473776	169473633	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	87243	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	7019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	8529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	169690222	169690462	169690289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417E7.1	129203	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr6	169827902	169828288	169828095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417E7.1	266883	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr6	170654095	170654292	170654195	Y	FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	56304	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr6	170838453	170838652	170838543	Y	NA	PSMB1,TBP	NA	NA	NA	NA	PSMB1	21777	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	655576	655910	655797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	97643	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	1198505	1198792	1198744	Y	NA	C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	1500451	1500958	1500750	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	3313	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2077835	2078163	2078150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	192715	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2150639	2150902	2150796	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	119976	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2647516	2647699	2647608	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	21886	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2744937	2745164	2745051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	75352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr7	5231323	5231672	5231498	Y	WIPI2	WIPI2	NA	NA	NA	NA	WIPI2	3504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	7216835	7216977	7216903	Y	NA	C1GALT1	C1GALT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	22270	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34350	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	18540943	18541343	18541016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	416371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	18575593	18575869	18575740	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	451021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	18583507	18583829	18583636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	458935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	18678711	18679112	18678888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	554139	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	20386006	20386499	20386153	Y	ITGB8	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	17681	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	NA	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	ITGB8	469105	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	23488792	23489118	23488955	Y	KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	18968	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	24813861	24813988	24813926	Y	OSBPL3	DFNA5	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	DFNA5	6617	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	24823380	24823654	24823545	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	16136	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	24873300	24873378	24873328	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	66056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBADH	126629	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	23488	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	28823277	28823529	28823406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	409538	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	29951912	29952143	29952027	Y	ZNRF2,C7orf41	NA	NA	NA	NA	NA	SCRN1	75762	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	36231264	36231478	36231421	Y	HERPUD2,EEPD1	EEPD1	NA	NA	NA	NA	EEPD1	40506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	415606	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	38379769	38380269	38379922	Y	NA	AC006033.22	NA	NA	NA	NA	AC006033.22	30785	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	38695355	38695603	38695479	Y	NA	AMPH	AMPH	IMR90	Hi-C	24141950	AMPH	26188	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	40129508	40130170	40129872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	141872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	44845785	44846169	44845977	Y	DDX56	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	11506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	44936968	44937252	44937141	Y	OGDH,MYO1G,PURB	PURB	TBRG4,OGDH	IMR90	Hi-C	24141950	PURB	14008	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47293209	47293414	47293276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	326742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47475545	47475747	47475668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	144409	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47517591	47517776	47517700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	102380	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47641076	47641289	47641172	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	20920	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	35030	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	6293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	55142882	55143327	55143024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	58168	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	56606357	56606502	56606382	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-725G10.3	377519	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	66343310	66343680	66343495	Y	NA	NA	C7orf42	IMR90	Hi-C	24141950	TYW1	114480	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	70983544	70983939	70983644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	1312838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	73015142	73015298	73015257	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	21575	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	73133049	73133354	73133303	Y	NA	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	1047	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	74020286	74020548	74020393	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	49446	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	75920543	75920716	75920673	Y	NA	HSPB1	HSPB1	IMR90	Hi-C	24141950	HSPB1	9145	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	76820393	76820583	76820488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC146	70642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	76874732	76875015	76874923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC146	124981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	77039475	77039927	77039691	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	124665	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	80488123	80488172	80488148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	61503	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	83662977	83663317	83663147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	456723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	83688045	83688341	83688303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	431699	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	87306649	87306854	87306752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P9	157872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	91466585	91467314	91466893	Y	NA	MTERF	NA	NA	NA	NA	MTERF	40720	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	92260832	92261202	92261012	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43124	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	92271612	92271814	92271678	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53904	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	317504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	247295	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	98557558	98557720	98557639	Y	KPNA7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3609	80285	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	MYH16	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	MYH16	24733	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	MYH16,ARPC1A	NA	NA	NA	NA	MYH16	37506	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	98907896	98908116	98908033	Y	ZKSCAN5,LOC100289187	ARPC1A	ARPC1A	IMR90	Hi-C	24141950	ARPC1A	13405	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	98978423	98978863	98978747	Y	SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	8551	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	99966641	99967146	99966944	Y	C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	29110	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	100749807	100749916	100749853	Y	TRIM56	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	18454	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	101062164	101062286	101062177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	99060	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	38459	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	104857177	104857523	104857432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	180232	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	104884738	104885065	104884890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	152690	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	105922869	105923204	105923197	Y	NA	NAMPT	NA	NA	NA	NA	NAMPT	1568	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	107142222	107142266	107142244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	59663	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	108139925	108140311	108140116	Y	PNPLA8,DNAJB9	RPL7P32	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	8366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	402356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	127806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFRD1	88745	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	116152142	116152412	116152205	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV1	10427	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	5.3193293455581
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	32371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr7	130669444	130669692	130669631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	73375	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	130875085	130875581	130875276	Y	NA	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	49768	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	131166569	131166943	131166757	Y	PODXL	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	74033	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr7	131239359	131239620	131239490	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	1356	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	132106504	132106703	132106622	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	658145	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	133093379	133093621	133093500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	157550	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	137661285	137661695	137661644	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	23118	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	139425752	139426584	139426362	Y	TBXAS1,JHDM1D	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	48993	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	141287085	141287318	141287296	Y	TAS2R5	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	38096	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	141512676	141512822	141512821	Y	TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	76555	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	FAM131B,AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr7	144473103	144473255	144473180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	58233	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.46912783405963
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.08147670043578
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr7	150317630	150317699	150317665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIMAP2	63086	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr7	156208710	156208799	156208755	Y	NA	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	RNF32	222176	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	157069496	157069783	157069568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	56292	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	582547	582966	582856	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	103140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	143269	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	8142177	8142516	8142347	Y	NA	NA	SGK223,CLDN23,MFHAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	99492	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	8147008	8147233	8147135	Y	NA	NA	SGK223,MFHAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	94775	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	121535	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR9	107393	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR9	172962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18424432	18424631	18424532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	398446	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	559229	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18704322	18704730	18704574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	678336	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	742871	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18940211	18940624	18940314	Y	NA	NA	LOC100128993,PSD3,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	732027	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18951503	18951869	18951728	Y	NA	NA	LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	720782	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr8	18985501	18986149	18985818	Y	NA	NA	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	686502	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18991999	18992391	18992140	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	680260	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	18993184	18993532	18993372	Y	NA	NA	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	679119	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18996849	18997050	18996949	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	675601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	674236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	605331	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	GFRA2	NA	NA	NA	NA	GFRA2	43311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	21817623	21817860	21817686	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	42443	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr8	22068132	22068339	22068246	Y	NA	BMP1,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	MIR320A	32217	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	22778460	22778609	22778534	Y	CHMP7	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10B	146083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10B	70297	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr8	26437404	26437761	26437433	Y	PNMA2,DPYSL2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	67613	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	27694349	27694720	27694534	Y	NA	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	737	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	30015593	30015700	30015665	Y	NA	RPS15AP24,DCTN6	NA	NA	NA	NA	DCTN6	3780	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	30666266	30666462	30666364	Y	NA	PPP2CB	NA	NA	NA	NA	PPP2CB	3368	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.31275188937309
chr8	36136186	36136422	36136302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	754905	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	37929132	37929304	37929218	Y	NA	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	37992032	37992208	37992120	Y	NA	ASH2L,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31272	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	38296830	38297166	38296953	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	27186	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	38330883	38331237	38331060	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	6531	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	41445863	41446158	41445968	Y	NA	AGPAT6	NA	NA	NA	NA	AGPAT6	13157	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	41570603	41570760	41570682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT6	137897	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	102452	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2	NA	NA	NA	NA	AP3M2	45369	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	42370484	42370865	42370805	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	24204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	48341345	48341518	48341449	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	161653	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	48853752	48854057	48853918	Y	NA	PRKDC,MCM4	NA	NA	NA	NA	PRKDC	16686	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	49034400	49034692	49034546	Y	NA	NA	SNAI2,EFCAB1,MCM4	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	115440	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	821254	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	54931181	54931405	54931291	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	1684	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	56796346	56796794	56796413	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	5974	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	58349607	58349625	58349616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	445204	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	59491466	59491801	59491581	Y	UBXN2B,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	27983	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	59959496	59959676	59959637	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	389093	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	62937802	62937913	62937858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	312455	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	66791613	66791826	66791725	Y	PDE7A	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	39056	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	80555	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	85794	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	4.39422858980887
chr8	67626224	67626609	67626278	Y	SGK3,VCPIP1,SGK3	VCPIP1,C8orf44,SGK3	NA	NA	NA	NA	SGK3	3571	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	1265662	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	90787257	90787620	90787439	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	19282	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	90794286	90794738	90794600	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	26311	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	91926136	91926682	91926246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	124276	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	101913945	101914105	101914022	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	7971	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	21757	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	102879018	102879156	102879087	Y	NCALD,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	370190	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	104198945	104199161	104199050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD6	109500	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	112672404	112672565	112672485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1714333	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	80121	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	125797387	125797699	125797500	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	RP11-1082L8.4	MTSS1,ZNF572	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1082L8.4	28225	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	126283499	126283849	126283769	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	156714	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	127844573	127844851	127844712	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	275935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	127927068	127927434	127927240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	301899	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128134721	128135121	128135085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	94212	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128167127	128167527	128167484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	61806	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	58021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46909	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	128203137	128203490	128203390	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	25843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr8	128227982	128228299	128228180	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1034	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	128305149	128305567	128305521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	75816	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr8	128309901	128310145	128310009	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	80568	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr8	128319902	128320220	128320122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	90569	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	123034	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr8	128353206	128353555	128353361	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	123873	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	7.16953085705657
chr8	128465837	128465850	128465844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	236504	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128523245	128523266	128523257	Y	NA	NA	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	222414	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr8	128630700	128630869	128630842	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	114811	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	128930937	128931257	128931067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	126158	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	248933	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	129139934	129140421	129140284	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	PVT1	335155	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PVT1	384046	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	156620	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr8	143049473	143049646	143049554	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	432955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	143532398	143532722	143532656	Y	LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	BAI1	3607	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	FAM83H	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H	29055	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	GRINA	NA	NA	NA	NA	GRINA	39118	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	GRINA	NA	NA	NA	NA	GRINA	35424	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	4174938	4175110	4175024	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	313334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	5459353	5459726	5459436	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	10850	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	6299	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	16666623	16666991	16666807	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	57821	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	20484725	20484943	20484834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-363E7.3	1022203	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313922	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313456	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	22012524	22012846	22012594	Y	NA	UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	2370	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	PLAA	618655	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	27733799	27733931	27733865	Y	C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	PLAA	788338	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	34193349	34193568	34193460	Y	NA	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	16346	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	35603577	35603740	35603659	Y	RECK	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	210	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	CLTA	42694	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	42928	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.5440270783104
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80021	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	2.77530226724771
chr9	75511457	75511847	75511682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	181511	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	75580383	75580516	75580515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A1	112842	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	17.3456391702982
chr9	75612445	75612548	75612497	Y	NA	NA	ALDH1A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1A1	80810	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	3.93167821193425
chr9	75764491	75764669	75764593	Y	ANXA1	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	4	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	75797609	75797655	75797632	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	32936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	90117444	90117744	90117580	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	DAPK1	7301	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	91022048	91022386	91022218	Y	NA	SPIN1	NA	NA	NA	NA	SPIN1	20714	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	145994	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	91762072	91762095	91762084	Y	NA	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	29587	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	91791946	91792374	91791976	Y	NA	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	264	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	6.24443010130734
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	94182259	94182597	94182338	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	1547	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	389324	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	FANCC	377937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	97852376	97852657	97852531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	225334	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	97968410	97968794	97968763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	109197	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	98210362	98210561	98210462	Y	PTCH1	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	23284	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	98619422	98619821	98619622	Y	NA	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	16438	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	99313149	99313340	99313245	Y	NA	NA	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	66772	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	100548546	100549029	100548790	Y	FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	90907	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	102767343	102767551	102767505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERP44	91771	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEFF1	9815	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	108474101	108474491	108474408	Y	TMEM38B	TMEM38B	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	19276	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	112162175	112162241	112162208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	80931	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	112578065	112578653	112578312	Y	PALM2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	319475	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	114389379	114389396	114389388	Y	NA	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10,GNG10	DNAJC25-GNG10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNAJC25	2236	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	116031847	116032083	116031965	Y	NA	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	3540	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	116304651	116305008	116304842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	99640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF15	792171	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	119466124	119466469	119466162	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	18543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	124260871	124261375	124261091	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	65961	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chr9	126002195	126002288	126002252	Y	OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	26567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	126624648	126624917	126624783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	65514	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	128408655	128409172	128408692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	58341	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	129185557	129185839	129185698	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	188883	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr9	130332837	130333195	130333149	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	6073	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	130342769	130343108	130342811	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3501	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	131929021	131929365	131929193	Y	NA	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	9175	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	132537165	132537327	132537245	Y	FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTGES	23839	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132712659	132713039	132713009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	90434	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	132793561	132793711	132793627	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	9762	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	91219	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.85020151149847
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	136012982	136013095	136013034	Y	RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	24206	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	138808024	138808108	138808066	Y	GLT6D1	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	10366	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	13.8765113362385
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL41	54881	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chrX	12990588	12990700	12990658	Y	TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	527	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	12991564	12992257	12991938	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	337	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13026247	13026553	13026429	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	TMSB4X,FAM9C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMSB4X	35020	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13041801	13041932	13041889	Y	TMSB4X,FAM9C	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	50574	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13105363	13105695	13105563	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	TMSB4X,FAM9C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMSB4X	114136	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13108770	13109761	13109358	Y	TLR8,TMSB4X	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	117543	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13208985	13209208	13209149	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	GS1-600G8.5	110363	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13275429	13275630	13275533	Y	TLR7	GS1-600G8.5	NA	NA	NA	NA	GS1-600G8.5	43941	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	13306086	13306254	13306170	Y	NA	GS1-600G8.5	TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GS1-600G8.5	13317	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chrX	13318186	13318365	13318276	Y	NA	GS1-600G8.5	NA	NA	NA	NA	GS1-600G8.5	1206	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chrX	13414990	13415289	13415163	Y	NA	NA	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GS1-600G8.5	95419	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	16492580	16492905	16492740	Y	NA	NA	CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	CTPS2	236154	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	21945015	21945333	21945248	Y	NA	SMS	SMS,MBTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	11358	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	22253958	22253963	22253961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	297267	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	39961698	39961932	39961714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	72650	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	70718	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	41190836	41191010	41190932	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	185	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	41413588	41413590	41413589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	222937	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	375123	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	655254	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45305345	45305614	45305509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-245M24.1	57019	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45663739	45663972	45663886	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	44948	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	46435390	46435934	46435628	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	4171	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	46487332	46487848	46487692	Y	RP2,ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	56113	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.38765113362385
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	47492098	47492440	47492261	Y	ARAF,CFP,CFP	SYN1,CFP,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	CFP	4394	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	54207248	54207470	54207359	Y	NA	FAM120C	NA	NA	NA	NA	FAM120C	244	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	62772082	62772285	62772184	Y	NA	RP11-357C3.3	NA	NA	NA	NA	RP11-357C3.3	6666	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145914	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.15637594468654
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	71343441	71343560	71343500	Y	FLJ44635	RGAG4	NA	NA	NA	NA	RGAG4	6198	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	73338057	73338325	73338191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53400	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	87351155	87351521	87351339	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	929	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	97535019	97535198	97535109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL4	2449912	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	109121537	109121700	109121615	Y	ACSL4,TMEM164,TMEM164	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM164	122159	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	303352	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrX	117631588	117631815	117631704	Y	NA	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	3727	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	117832529	117832854	117832630	Y	DOCK11,LONRF3,IL13RA1	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	26681	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	117843836	117843978	117843907	Y	LONRF3	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	15557	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	119076607	119076872	119076702	Y	NKRF	NKAP	NA	NA	NA	NA	NKAP	872	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	1.61892632256116
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	129121612	129121744	129121653	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	8529	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	135927542	135927922	135927796	Y	NA	RBMX	ARHGEF6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMX	33001	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.925100755749235
chrX	153309720	153309889	153309786	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	26289	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.231275188937309
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.462550377874618
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAGE	MIA Paca2	hg19	FANTOM5	0.693825566811926